棚户区改造资金的合法处理方式是：可能采取的补偿方式包括货币补偿、或者房屋产权调换。
根据《国有土地上房屋征收与补偿条例》第十七条作出房屋征收决定的市、县级人民政府对被征收人给予的补偿包括：
(一)被征收房屋价值的补偿;
(二)因征收房屋造成的搬迁、临时安置的补偿;
(三)因征收房屋造成的停产停业损失的补偿。
市、县级人民政府应当制定补助和奖励办法，对被征收人给予补助和奖励。
棚户区改造的标准是：
1.应当符合公共利益的需要。
2.符合“三规划一计划”。具体是指社会发展规划、土地利用总体规划、城乡规划和专项规划。市、县级国民经济和社会发展年度计划。
3.完善的棚户区改造规划。各地区要进一步摸清待改造棚户区的底数、面积、类型等情况的基础上，编制棚户区改造规划，且应当突出规划的前瞻性、科学性。
4.社会稳定风险评估。市、县级人民政府作出房屋征收决定前，应当按照有关规定进行社会稳定风险评估;房屋征收决定涉及被征收人数较多的，应当经政府常务会议讨论决定。
5.征收补偿费用必须落实到位。由于棚户区改造项目涉及人数众多，为保证项目的顺利推进，作出房屋征收决定前，征收补偿费用应当足额到位、专户存储、专款专用。
棚户区的认定是指简易房屋和棚厦房屋集中区，即城市中结构简陋、抗灾性差、居住拥挤、功能差、居住环境差、无道路、无绿化、无公共活动场地、采光通风差的房屋集中的地方。找法网提醒您，棚户区的改造是我国政府为改造城镇危旧住房、改善困难家庭的住房条件而推出的一项民心工程。
