旷工扣工资合理的方法是：
用人单位可根据劳动合同的约定和用人单位的规章制度中的相关规定来扣工资。如果因旷工而给单位造成损失的，单位每月最多可从劳动者的工资中扣除不超过20%的数额。
《工资支付暂行规定》第七条
工资必须在用人单位与劳动者约定的日期支付。如遇节假日或休息日，则应提前在最近的工作日支付。工资至少每月支付一次，实行周、日、小时工资制的可按周、日、小时支付工资。
《工资支付暂行规定》第九条
劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。
《工资支付暂行规定》第十六条
因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
找法网提醒您，旷工不会算自动离职。如果劳动者旷工的，用人单位会依据其依法制定的规章制度给予劳动者相应的处罚；情节严重的，可能会依法辞退员工。但是旷工不会产生自动离职的效果。
《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条
【用人单位单方解除劳动合同（过失性辞退）】劳动者有下列情形之一的，用人单位可以解除劳动合同：
（一）在试用期间被证明不符合录用条件的；
（二）严重违反用人单位的规章制度的；
（三）严重失职，营私舞弊，给用人单位造成重大损害的；
（四）劳动者同时与其他用人单位建立劳动关系，对完成本单位的工作任务造成严重影响，或者经用人单位提出，拒不改正的；
（五）因本法第二十六条第一款第一项规定的情形致使劳动合同无效的；
（六）被依法追究刑事责任的。
旷工的认定标准如下：没有按照用人单位规定提供劳动；没有正当理由；没有经过用人单位同意。其中旷工连续十五天以内或一年累计三十天以内的，不发年度奖金旷工连续超过十五天或一年内累计超过三十天的，予以辞退。旷工，是指职工在正常工作日无正当理由不请假或请假未批准的缺勤行为，属于严重违纪行为。
