员工自动辞职一般是没有经济补偿的，但用人单位有过错的，可以要求用人单位支付经济补偿。
《劳动合同法》第三十八条，用人单位有下列情形之一的，劳动者可以解除劳动合同：
（一）未按照劳动合同约定提供劳动保护或者劳动条件的；
（二）未及时足额支付劳动报酬的；
（三）未依法为劳动者缴纳社会保险费的；
（四）用人单位的规章制度违反法律、法规的规定，损害劳动者权益的；
（五）因本法第二十六条第一款规定的情形致使劳动合同无效的；
（六）法律、行政法规规定劳动者可以解除劳动合同的其他情形。
《劳动合同法》第四十六条第一项规定，劳动者依照本法第三十八条规定解除劳动合同的，用人单位应当向劳动者支付经济补偿。
员工擅自离岗的，用人单位应当首先发出书面通知，限制员工在规定期限内返回公司。其次，当员工擅自离岗达到辞退标准时，用人单位应当以书面形式向该员工送达辞职通知，通知其前来办理交接和离职手续。另外，如果该员工由于擅自离岗，给用人单位造成损失的，用人单位可以申请仲裁，向劳动者要求赔偿。
劳动者离职后，用人单位应当为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。此时社保会出现停止交费和社保转移的情形，前者情形下参保人可以以灵活就业人员名义缴纳社保费用。
《劳动合同法》第五十条第一款
用人单位应当在解除或者终止劳动合同时出具解除或者终止劳动合同的证明，并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。
《社会保险法》第四条
中华人民共和国境内的用人单位和个人依法缴纳社会保险费，有权查询缴费记录、个人权益记录，要求社会保险经办机构提供社会保险咨询等相关服务。
个人依法享受社会保险待遇，有权监督本单位为其缴费情况。
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