单位是有权与劳动者约定违约金的，但除违反服务期、竞业限制外，不得约定由员工支付违约金。违反服务期约定的违约金数额不得超过用人单位提供的培训费用。违反竞业限制的违约金数额法律未作限制，不过过高的可以申请仲裁降低。
《中华人民共和国劳动合同法》第二十三条用人单位与劳动者可以在劳动合同中约定保守用人单位的商业秘密和与知识产权相关的保密事项。
对负有保密义务的劳动者，用人单位可以在劳动合同或者保密协议中与劳动者约定竞业限制条款，并约定在解除或者终止劳动合同后，在竞业限制期限内按月给予劳动者经济补偿。劳动者违反竞业限制约定的，应当按照约定向用人单位支付违约金。
劳动合同违约金纠纷的处理途径如下：
1.协商，协商达成的协议没有强制执行力，当事人仍然可以申请仲裁或起诉。
2.调解，解决劳动争议中的调解，主要由企业内部的劳动争议调解委员会进行。调解达成协议后，争议双方应自觉履行，但没有强制执行力。
3.仲裁，劳动争议仲裁在我国是由劳动争议仲裁委员会进行的。仲裁裁决具有强制执行力。
劳动合同违约金一年内仲裁有效。从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。因不可抗力或者有其他正当理由时效中止的，从中止时效的原因消除之日起，仲裁时效期间继续计算。因当事人一方向对方当事人主张权利等原因而中断的，从中断时起，仲裁时效期间重新计算。
找法网提醒您，根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。
