发生工伤事故赔偿纠纷，可通过以下方法处理：用人单位与劳动者协商；向基层人民调解组织、企业劳动争议调解委员会或者在乡镇、街道设立的具有劳动争议调解职能的组织申请调解；向劳动争议仲裁委员会申请仲裁；对仲裁裁决不服的，向人民法院提起诉讼。
《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第五条
【劳动争议处理的基本程序】发生劳动争议，当事人不愿协商、协商不成或者达成和解协议后不履行的，可以向调解组织申请调解；不愿调解、调解不成或者达成调解协议后不履行的，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁；对仲裁裁决不服的，除本法另有规定的外，可以向人民法院提起诉讼。
工伤主张赔偿应该写明当事人信息、劳动关系、入职时间、工作岗位和工资报酬，以及受伤时间、地点和原因。找法网提醒您，协议中应该有双方对赔偿的事宜、赔偿金额、赔偿项目、赔偿金给付方式、违约赔偿等协商一致，并约定在工伤赔偿协议中，如果是分期赔偿的，应该将最后支付结束的时间也写清楚和明确。协议应该签字、盖章生效，写明日期。双方记得要各持一份协议书。
申请工伤事故赔偿的流程如下：
1.当事人向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请并提交劳动关系证明、医疗诊断证明等材料；
2.社会保险行政部门受理工伤认定申请后，根据审核需要对事故伤害进行调查核实；
3.社会保险行政部门作出工伤认定的决定；
4.社会保险行政部门将《认定工伤决定书》送达当事人，并抄送社会保险经办机构。
根据《工伤保险条例》第十七条第一款规定，职工发生事故伤害或者按照职业病防治法规定被诊断、鉴定为职业病，所在单位应当自事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起30日内，向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请
遇有特殊情况，经报社会保险行政部门同意，申请时限可以适当延长。
