工厂停产期间员工如下保障自身权益：
1.协商处理，劳动者可以与用人单位协商，也可以请工会或第三方共同与用人单位协商，达成和解协议；
2.调解处理：到企业劳动争议调解委员会或者人社部门劳动争议调解申请调解；
3.申请仲裁：不愿调解、调解不成或达成调解协议后未履行的，劳动者可向有管辖权的劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁；
4.提起诉讼：对仲裁不服的，保留相关证据材料，去人民法院提起劳动争议诉讼。
劳动者合法权益有就业权、劳动合同签订权、劳动报酬权、休息权、劳动安全卫生保护权、职业培训权、社会保险福利权、劳动争议处理权等。找法网提醒您，劳动者义务主要包括：
1.劳动者应完成的劳动任务；
2.提高职业技能；
3.行劳动安全卫生规程；
4.遵守劳动纪律和职业道德。
劳动者的合法权益是指劳动者在劳动过程中依法享有并受到法律保护的权利。
劳动维权仲裁时效是一年。从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。劳动争议仲裁委员会收到仲裁申请之日起五日内决定是否受理。仲裁庭裁决劳动争议案件，应当自劳动争议仲裁委员会受理仲裁申请之日起四十五日内结束。
《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。
