工厂小时工旷工根据公司的规章进行处理，一般的公司都规定旷工三天给予辞退的处理。
《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条【用人单位单方解除劳动合同(过失性辞退)】劳动者有下列情形之一的，用人单位可以解除劳动合同：
(一)在试用期间被证明不符合录用条件的;
(二)严重违反用人单位的规章制度的;
(三)严重失职，营私舞弊，给用人单位造成重大损害的;
(四)劳动者同时与其他用人单位建立劳动关系，对完成本单位的工作任务造成严重影响，或者经用人单位提出，拒不改正的。
旷工一天扣三天工资不合法，因为劳动合同法规定了用人单位应按劳动合同规定的标准支付劳动者工资，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资，旷工一天应当指扣除当天的工资，扣三天不合法。
《中华人民共和国劳动合同法》第三十条
用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。用人单位拖欠或者未足额支付劳动报酬的，劳动者可以依法向当地人民法院申请支付令，人民法院应当依法发出支付令。
用人单位违法解除合同，需要向劳动者支付双倍经济补偿。找法网提醒您，如果劳动者确有严重违反用人单位的规章制度，且该制度经工会及全体职工代表讨论通过，并由全体劳动者签字确认，则应认定该制度符合法律规定，用人单位依照该制度辞退劳动者属于行使用工自主权的表现，并无需向劳动者支付经济补偿金。
