工厂旷工要按照规章制度来处理，如有的用人单位规定第一次旷工，通过口头或书面警告，让本人认识错误并责令反省；第二次旷工，通报批评给予员工警示，由主管领导进行谈话，记大过处分；第三次旷工，开除或劝退。找法网提醒，一般情况下，有如下情况的视为旷工：没有按照用人单位规定提供劳动；没有正当理由旷工；没有经过用人单位同意。
工人迟到是否可以扣工资要看用人单位的规章制度中是否有规定。员工上班迟到被扣工资，如果用人单位的规章制度有明确规定的，是合法的；如果规章制度和劳动合同都没有规定，那么用人单位属于克扣劳动者工资，由劳动行政部门责令支付。
工厂辞退在操作中需要注意如下事项：
1.在试用期内，企业可单方面解除劳动合同，但前提是员工被证明不符合录用条件，因此，录用条件的设计十分重要，对此，企业应当明确录用条件，将其向员工公示并以存档，以备不时之需。
2.员工给单位造成重大损害，企业可以解除劳动合同，但何谓“重大损害”，在劳动合同或规章制度中，企业应予以明确，尽量避免“泛泛而谈”，从而导致在发生争议时处于不利境地。
3.员工以欺诈、胁迫的手段或乘人之危，使企业在违背自身真实意思的情况下订立劳动合同，企业可随时解除劳动合同，但应注意的是，只有劳动仲裁机构或法院才有权确认劳动合同无效。
4.“被依法追究刑事责任”，根据相关规定，是指被人民检察院免于起诉、被人民法院判处刑罚的、被人民法院根据《刑法》第三十二条免于刑事处分的。
