用人单位解除劳动合同主要依据《劳动合同法》的第三十九条（过失性解除）、第四十条（非过失性解除）和第四十一条（经济性裁员）。《劳动合同法》第四十二条规定劳动者患病或者非因工负伤，在规定的医疗期内不得依据第四十条和第四十一条解除劳动合同。那么，依据第三十九条是可以解除的，医疗期内的员工如果有第三十九条规定情形的同样可以解除，具体情形如下：
在试用期间被证明不符合录用条件的；严重违反用人单位的规章制度的；严重失职，营私舞弊，给用人单位造成重大损害的；劳动者同时与其他用人单位建立劳动关系，对完成本单位的工作任务造成严重影响，或者经用人单位提出，拒不改正的；因以欺诈、胁迫的手段或者乘人之危，使对方在违背真实意思的情况下订立或者变更劳动合同致使劳动合同无效的；被依法追究刑事责任的。你可能会疑惑，医疗期在休病假怎么会有以上情形呢？还是会存在的，比如请病假需要履行相应的请假手续，未按规定请假，这本身就是违纪行为，达到一定的次数就可以界定为严重违纪；伪造病历、病假条，与人串通开病假条等都可以规定为是违纪行为等等。
所以，在员工医疗期，存在正当原因，还是可以解除劳动合同的。
医疗期的长短取决于本人实际参加工作年限和在本单位连续工作年限，给予三个月到二十四个月的医疗期。公司同意的话，也可以延长医疗期。所以不是治疗时间多长，医疗期就多长。一般规定：实际工作年限十年以下的，在本单位工作年限五年以下的为三个月；五年以上的为六个月。实际工作年限十年以上的，在本单位工作年限五年以下的为六个月；五年以上十年以下的为九个月；十年以上十五年以下的为十二个月；十五年以上二十年以下的为十八个月；二十年以上的为二十四个月。
在医疗期期间，公司应当照常支付员工工资，但是具体并没有统一的规定。公司可以根据各地的规定来自行制定本单位的医疗期工资制度，只是最低不能低于当地最低工资的８０％。
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