1、行为性质的区别。滥用职权罪在客观方面的本质属性是对职权的“滥用”，玩忽职守罪在客观方面的本质属性是对职守的“玩忽”。
2、行为方式的区别。滥用职权罪主要表现为作为，玩忽职守罪多数表现为不作为。
3、立案条件的区别。根据相关司法解释，滥用职权造成死亡1人，或者重伤2人、轻伤5人以上即可立案；玩忽职守除造成死亡1人以外，重伤要3人、轻伤10人以上才能立案。滥用职权造成直接经济损失达20万元即可立案；玩忽职守则要30万元才能立案。
4、犯罪客体的区别。滥用职权罪的直接客体是国家机关工作人员职务活动的正当性，玩忽职守罪的直接客体是国家机关工作人员职务活动的勤政性。
