合伙合同纠纷的管辖法院通常应该选择被告人所在地或者合同履行地的民事法院起诉。
《民事诉讼法》第二十四条
因合同纠纷提起的诉讼，由被告住所地或者合同履行地人民法院管辖。
合伙协议纠纷的处理：
1.协商解决；
2.通过第三者调解解决；
3.申请仲裁。不愿通过协商、调解解决或者协商、调解不成的，可以按照合伙协议约定的仲裁条款或者事后达成的书面仲裁协议，向仲裁机构申请仲裁；
4.诉讼途径解决。合伙协议中未订立仲裁条款，事后又没有达成书面仲裁协议的，可以向人民法院起诉。
《中华人民共和国合伙企业法》第三十三条
合伙企业的利润分配、亏损分担，按照合伙协议的约定办理；合伙协议未约定或者约定不明确的，由合伙人协商决定；协商不成的，由合伙人按照实缴出资比例分配、分担；无法确定出资比例的，由合伙人平均分配、分担。
合伙协议不得约定将全部利润分配给部分合伙人或者由部分合伙人承担全部亏损。
诉讼时效规定是3年，自权利人知道或者应当知道权利受到损害时开始计算，权利人在诉讼时效期间内不行使权利，当时效期间届满时，债务人获得诉讼时效抗辩权。
找法网提醒您，《中华人民共和国民法典》第一百八十八条，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。 诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。
