在医疗期内公司不能降职降薪，属于违法行为，劳动者可以先向本单位劳动争议调解委员会申请调解。调解不成，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。也可以直接向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。对仲裁裁决不服的，可以直接向人民法院提起诉讼。
《工伤保险条例》第三十三条职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。
停工留薪期一般不超过12个月。伤情严重或者情况特殊，经设区的市级劳动能力鉴定委员会确认，可以适当延长，但延长不得超过12个月。工伤职工评定伤残等级后，停发原待遇，按照本章的有关规定享受伤残待遇。工伤职工在停工留薪期满后仍需治疗的，继续享受工伤医疗待遇。
生活不能自理的工伤职工在停工留薪期需要护理的，由所在单位负责。
合法的调岗降薪流程一般是这样的：
1.公司人事部门要提前跟员工确认需要进行协商变更的内容。
2.确定变更的内容之后，就以书面的形式向员工发出变更合同的意向，并对变更的法律依据及客观事实情况要进行解释说明。
3.跟员工达成一致，取得员工的同意，然后需要员工以书面形式确认，并在原劳动合同的变更页上填写变更内容并由双方签字确认。
4.将变更后的劳动合同交予员工一份，单位保留一份。
找法网提醒您，强行调岗降薪申请劳动仲裁流程如下：
1.要注意搜集证据，特别注意对劳动合同、社保清单、工牌或工作证、工资发放记录、公司给与员工调岗降薪的通知、文件等证据的搜集和整理。
2.及时向劳动仲裁委提出仲裁申请，避免超过诉讼时效，从公司调岗降薪之日起一年内要提出仲裁申请，否则超过诉讼时效面临败诉风险，另需要注意要向用人单位所在地的劳动仲裁委提出申请。
