公司按劳动者迟到的分钟数扣钱是合法的，除此之外，用人单位应依法在规章制度中明确上班迟到扣除工资的要求及标准，并已进行公开公示告知员工，且所扣工资必须少于劳动者当月工资的20%。
法律依据：《工资支付暂行规定》第十六条
因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
申请劳动仲裁裁决书一般会在四十五日内下达，案情复杂的不能超过六十日。仲裁庭裁决劳动争议案件，应当自劳动争议仲裁委员会受理仲裁申请之日起四十五日内结束。仲裁庭裁决劳动争议案件时，其中一部分事实已经清楚，可以就该部分先行裁决。
劳动仲裁结果不公可以向人民法院起诉，根据《劳动争议调解仲裁法》，劳动者对劳动仲裁结果不服的，可以自收到仲裁裁决书之日起十五日内向人民法院提起诉讼。
找法网提醒您，根据《中华人民共和国劳动法》第七十九条劳动争议发生后，当事人可以向本单位劳动争议调解委员会申请调解；调解不成，当事人一方要求仲裁的，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。当事人一方也可以直接向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。对仲裁裁决不服的，可以向人民法院提起诉讼。
