公司应在员工离职后结清工资是：用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。工资应当以货币形式来支付，且要按照双方在劳动合同中的约定和员工的工作天数来算。
找法网提醒您，根据《工资支付暂行规定》第七条工资必须在用人单位与劳动者约定的日期支付。如遇节假日或休息日，则应提前在最近的工作日支付。工资至少每月支付一次，实行周、日、小时工资制的可按周、日、小时支付工资。
第八条对完成一次性临时劳动或某项具体工作的劳动者，用人单位应按有关协议或合同规定在其完成劳动任务后即支付工资。
第九条劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。
1.当事人向劳动争议仲裁委员会递交仲裁申诉书以及相关材料；
2.劳动争议仲裁委员会决定是否受理；
3.劳动争议仲裁委员会受理后五日内向被申请人送达仲裁申请书副本；
4.被申请人提交答辩书；
5.仲裁庭开庭审理、调解；
6.做出裁决。
《劳动争议调解仲裁法》第二十九条劳动争议仲裁委员会收到仲裁申请之日起五日内，认为符合受理条件的，应当受理，并通知申请人；认为不符合受理条件的，应当书面通知申请人不予受理，并说明理由。对劳动争议仲裁委员会不予受理或者逾期未作出决定的，申请人可以就该劳动争议事项向人民法院提起诉讼。
劳动者擅自离职不需要支付违约金，但是擅自离职给用人单位造成损失的，应当进行赔偿。《劳动合同法》规定了两种情形下劳动者需要支付违约金，一是违反服务期的约定，二是违反了竞业限制的约定。
《中华人民共和国劳动合同法》第三十七条劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。劳动者在试用期内提前三日通知用人单位，可以解除劳动合同。
