公司税务登记证申请的办理程序是：
1.自领取营业执照之日起30日内，从事生产、经营的纳税人应当向生产、经营地或者纳税义务发生地的主管税务机关申报办理税务登记；
2.税务登记机关审查申请材料。
确认符合条件的，发给税务登记证。
《中华人民共和国税收征收管理法实施细则》第十二条
从事生产、经营的纳税人应当自领取营业执照之日起30日内，向生产、经营地或者纳税义务发生地的主管税务机关申报办理税务登记，如实填写税务登记表，并按照税务机关的要求提供有关证件、资料。
前款规定以外的纳税人，除国家机关和个人外，应当自纳税义务发生之日起30日内，持有关证件向所在地的主管税务机关申报办理税务登记。
个人所得税的纳税人办理税务登记的办法由国务院另行规定。
税务登记证件的式样，由国家税务总局制定。
1.增值税：小规模纳税人可免征;一般纳税人税率为6%、9%、13%
2.附加税费：便是城建税、教育费附加和地方教育费附加，这个是在增值税上附加税费。
3.企业所得税：依据企业在一段时期发生利润而征收的税。如今小微企业税收优惠，100万部分2.5%征收;100-300万部分5%征收。
4.个人所得税：倘若股东分红，要交纳20%的个人所得税，这一个税收是股东承担，但有分配利润的企业代扣代缴。
5.印花税：企业实缴注册资本、签订合同要缴纳印花税，但印花税税率很低，一般来说税收都不怎么高。
找法网提醒您，公司缴纳税务的程序是：
1.纳税人向国税局的征管部门提出网上申报纳税申请，经县(市)区局审批同意后，正式参与网上申报纳税。
2.纳税人向税务机关提供在银行已经开设的缴税账户，并保证账户中有足够用于缴税的资金。
3.纳税人与银行签署委托划款协议，委托银行划缴税款。
4.纳税人利用计算机和申报纳税软件制作纳税申报表，并通过电话网、因特网传送给税务机关的计算机系统。
5.税务机关将纳税人的应划缴税款信息，通过网络发送给有关的银行。由银行从纳税人的存款账户上划缴税款，并打印税收转帐专用完税证。
6.银行将实际划缴的税款信息利用网络传送给税务机关的计算机系统。
7.其它。
