企业纠纷到底应该通过如下程序解决：
1.劳动者与用人单位协商；
2.向基层人民调解组织、企业劳动争议调解委员会或在乡镇、街道设立的具有劳动争议调解职能的组织申请调解；
3.调解不成，向劳动争议仲裁委员会申请仲裁；
4.对仲裁裁决不服，向人民法院提起诉讼。
《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第五条
【劳动争议处理的基本程序】发生劳动争议，当事人不愿协商、协商不成或者达成和解协议后不履行的，可以向调解组织申请调解；不愿调解、调解不成或者达成调解协议后不履行的，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁；对仲裁裁决不服的，除本法另有规定的外，可以向人民法院提起诉讼。
找法网提醒您，劳动纠纷申请仲裁的时效期间为一年，从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。劳动者申请仲裁属于劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬发生争议的，不受仲裁时效期间限制。但劳动关系终止的，应当自劳动关系终止之日起一年内提出。
《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条
【仲裁时效】劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。
前款规定的仲裁时效，因当事人一方向对方当事人主张权利，或者向有关部门请求权利救济，或者对方当事人同意履行义务而中断。从中断时起，仲裁时效期间重新计算。
因不可抗力或者有其他正当理由，当事人不能在本条第一款规定的仲裁时效期间申请仲裁的，仲裁时效中止。从中止时效的原因消除之日起，仲裁时效期间继续计算。
劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬发生争议的，劳动者申请仲裁不受本条第一款规定的仲裁时效期间的限制；但是，劳动关系终止的，应当自劳动关系终止之日起一年内提出。
劳动争议纠纷包括：
1.因订立、履行、变更、解除和终止劳动合同发生的争议；
2.因除名、辞退和辞职、离职发生的争议；
3.因工作时间、休息休假、社会保险、福利、培训以及劳动保护发生的争议；
4.因劳动报酬、工伤医疗费、经济补偿或者赔偿金等发生的争议；
5.劳动者与用人单位在履行劳动合同过程中发生的纠纷；
6.劳动者与用人单位之间没有订立书面劳动合同，但已形成劳动关系后发生的纠纷；
7.劳动者退休后，与尚未参加社会保险统筹的原用人单位因追索养老金、医疗费、工伤保险待遇和其他社会保险费而发生的纠纷。
