处理拆迁款纠纷的途径有协商，拆迁人与被拆迁人可以通过直接对话的方式达成和解协议。协商无法解决的可以司法起诉，运用法律手段与国家强制力维权自己的合法权益。
找法网提醒您，根据《国有土地上房屋征收与补偿条例》第二十五条，房屋征收部门与被征收人依照本条例的规定，就补偿方式、补偿金额和支付期限、用于产权调换房屋的地点和面积、搬迁费、临时安置费或者周转用房、停产停业损失、搬迁期限、过渡方式和过渡期限等事项，订立补偿协议。补偿协议订立后，一方当事人不履行补偿协议约定的义务的，另一方当事人可以依法提起诉讼。
房屋拆迁民事纠纷诉讼时效是三年；提起行政诉讼的时效为六个月。
《民法典》第一百八十八条 向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。
诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。
拆迁纠纷中的被告有两种：
1.拆迁行政管理部门。一般而言，拆迁行政管理部门作出拆迁许可、拆迁决定、拆迁补偿裁决等行政行为的，原告不服提起行政诉讼的，拆迁行政管理部门为被告。
2.人民政府。城市房屋拆迁行政诉讼中，以人民政府为被告的一般是以下几种情形：
（1）由人民政府下属的“拆迁办公室”充当拆迁人同时又作出许可决定和裁决;
（2）由人民政府或者土地管理局成立的临时性组织，如“拆迁指挥部”等充当拆迁人，同时作出许可决定和裁决;
（3）由政府专门成立的土地储备中心充当差遣人由人民政府作出裁决。在城市房屋拆迁行政纠纷时，出现以上三种情形的，人民政府为房屋拆迁行政诉讼的被告。
