旷工离职扣工资的处理是可以进行协商，协商不成的，可以到劳动监察大队投诉或者申请劳动仲裁维权。 法律依据：
《中华人民共和国劳动法》第五十条 工资支付形式工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
找法网提醒您，旷工的认定标准如下：
1.没有按照用人单位规定提供劳动；
2.没有正当理由；
3.没有经过用人单位同意。
其中旷工连续十五天以内或一年累计三十天以内的，不发年度奖金旷工连续超过十五天或一年内累计超过三十天的，予以辞退。
旷工，是指职工在正常工作日无正当理由不请假或请假未批准的缺勤行为，属于严重违纪行为。
长期旷工单位能开除员工。
单位以旷工解除劳动关系是否合法如果公司有相关的管理制度，并提前告知，单位依据制度解除劳动合同就是有效的。
用人单位可以根据《劳动合同法》第三十九条的规定开除员工。用人单位需要根据《劳动合同法》第四十三条的规定办理开除员工的手续。用人单位单方解除劳动合同，应当事先将理由通知工会。用人单位违反法律、行政法规规定或者劳动合同约定的，工会有权要求用人单位纠正。用人单位应当研究工会的意见，并将处理结果书面通知工会。如果用人单位未按照劳动合同法第四十三条规定事先通知工会，劳动者可以以用人单位违法解除劳动合同为由请求用人单位支付赔偿金，人民法院予以支持。
