双休期间加班费根据《劳动法》第四十四条的规定：休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬，用人单位可以安排调休代替。
计算公式为：月工资标准÷（月计薪天数21.75×8小时）×200%。
正常工作日延长工作时间进行加班的，应当支付不低于工资的150%的工资报酬，其计算公式为劳动合同规定的月工资标准÷（月计薪天数21.75×8小时）×150%；安排法定节假日加班的，不可用调休代替，应当支付不低于工资的300%的工资报酬，其计算公式为劳动合同规定的月工资标准÷（月计薪天数21.75×8小时）×300%。
加班工资仲裁时效为一年。找法网提醒您：劳动者未离职的，仲裁时效不受一年仲裁时效期间的限制；但是，劳动者离职的，仲裁申请应当自劳动关系终止之日起一年内提出。
法律依据：根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条 劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。前款规定的仲裁时效，因当事人一方向对方当事人主张权利，或者向有关部门请求权利救济，或者对方当事人同意履行义务而中断。从中断时起，仲裁时效期间重新计算。
加班费应当扣税。加班费属于员工正常的薪资，并不属于国家统一规定的免税项目，所以加班费应当计入个税起征点，即并入当月的工薪收入的个人所得税，进行依法纳税。
法律依据：根据《个人所得税法》第二条下列各项个人所得，应当缴纳个人所得税：
（一）工资、薪金所得；
（二）劳务报酬所得；
（三）稿酬所得；
（四）特许权使用费所得；
（五）经营所得；
（六）利息、股息、红利所得；
（七）财产租赁所得；
（八）财产转让所得；
（九）偶然所得。
