行政赔偿程序与刑事赔偿程序的不同在以下几个方面：
1、行政赔偿程序中，赔偿请求经赔偿义务机关处理后，请求人不服的，不需要再向赔偿义务机关的上一级机关复议;而在刑事赔偿程序中，请求人对赔偿义务机关的行为不服还不能马上诉诸法院，而必须向赔偿机关的上一级机关申请复议。
2、行政赔偿请求人只有在行政赔偿义务机关先行处理后不服的，才可以向人民法院起诉;而刑事赔偿请求人在赔偿义务机关的上一级机关复议之后不服的，由中级以上人民法院设立的赔偿委员会作出裁决。
3、行政赔偿请求可以在申请行政复议或者提起行政诉讼时附带提起，此时不需要行政赔偿义务机关先行处理;而刑事赔偿请求则必须先向赔偿义务机关提起。
