公司扣员工年终奖是否违法，主要取决于公司与员工之间是否有事先的约定：
1.在没有事先约定的情况下，公司有权决定是否发放年终奖，这是劳动法规未对此作出硬性规定的结果。换言之，如果公司并未承诺发放年终奖，那么扣发年终奖并不构成违法。
2.如果公司与员工之间有事先的明确约定，如劳动合同或公司规章制度中规定了年终奖的发放条件和标准，那么公司就必须按照约定执行。
3.如果公司扣发员工的年终奖，就违反了双方的约定，也违背了《劳动法》的相关规定。对于这种情况，当事人完全有权向当地劳动部门投诉，申请劳动仲裁，以索取自己应得的报酬。
年终奖的发放虽然灵活，但仍需遵循一定的法律规定和要点。
1.年终奖的发放应体现公司的年度业绩状况、员工的年度工作业绩，并与年初的业绩和激励计划保持一致。这既是对员工努力的认可，也是企业建立员工与企业利益共同体的关键。
2.年终奖的发放要把握好三个步骤：回顾年度计划和业绩协议、评价公司业绩和员工业绩、核算并发放奖金。这三个步骤确保了年终奖发放的公正性和透明度。
3.年终奖的考核也应注重公平性，包括外部公平和内部公平，以确保员工对企业薪酬制度的满意度和忠诚度。
找法网提醒你，科学评价和公平设计年终奖是确保员工激励效果的关键。
1.企业需要建立一套适合自身特色的绩效评估体系，并全力执行。在年终考核时，要避免陷入“工作绩效评价就是对员工人际关系的评价”的误区，而应客观公正地评价员工的工作业绩。
2.为了公平设计年终奖，企业应充分听取员工的意见，给予员工参与薪酬系统设计的机会。
3.公开企业的报酬结构和计算方法，使员工了解薪酬决策的程序，从而判断其合理性。这样的做法不仅能让员工感到受到尊重，还能减少在执行过程中的风险。
总之，科学评价和公平设计年终奖需要企业综合考虑多个因素，包括公司业绩、员工表现、公平性原则以及员工的参与和反馈等。
