可以。门窗欠款的诉讼时效是三年，自权利人知道或者应当知道权利受到损害之日起计算。如果欠门窗款已经超过两年，权利人仍可以提起诉讼。但是，如果自权利受到损害之日超过二十年，人民法院将不予保护。在特殊情况下，如果存在法律规定，可以申请适当延长诉讼时效。在具体案例中，如果欠款已经超过了两年，但是权利人在这三年内曾经向债务人主张过权利，那么诉讼时效就会发生中断，重新计算三年。因此，即使欠门窗款已经超过两年，权利人仍可以通过法律途径维护自己的合法权益。
法律依据：《民法典》第一百八十八条 向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。
诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。
找法网提醒您，欠款起诉的流程是：
1.向人民法院的立案庭提交起诉状，同时按照被告人数准备副本；
2.法院在经过一定的审查过后，如果认为符合法定起诉条件的，应当予以受理并在规定期限内立案；
3.适宜调解的，应当先行调解；
4.法院审理。
《民事诉讼法》第一百二十二条
起诉必须符合下列条件：
（一）原告是与本案有直接利害关系的公民、法人和其他组织；
（二）有明确的被告；
（三）有具体的诉讼请求和事实、理由；
（四）属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉人民法院管辖。
欠款起诉的法院一般是被告住所地的法院。
《民事诉讼法》第二十二条
对公民提起的民事诉讼，由被告住所地人民法院管辖；被告住所地与经常居住地不一致的，由经常居住地人民法院管辖。
对法人或者其他组织提起的民事诉讼，由被告住所地人民法院管辖。
同一诉讼的几个被告住所地、经常居住地在两个以上人民法院辖区的，各该人民法院都有管辖权。
