单独提起行政赔偿诉讼的起诉期限是在赔偿义务机关递交赔偿申请后的两个月届满之日起的三个月内向法院提起诉讼。法律规定，赔偿义务机关应当自收到申请之日起两个月内，作出是否赔偿的决定。赔偿义务机关在规定期限内未作出是否赔偿的决定或作出不予赔偿决定的，赔偿请求人可以自期限届满之日起三个月内，向人民法院提起诉讼。
找法网提醒您，政赔偿诉讼与行政诉讼的最大区别是：
1.两者诉讼请求不一致，赔偿诉讼突出的是赔偿请求;
2.两者举证责任不完全相同，赔偿诉讼以原告举证为原则，特殊情况下由被告举证;行政诉讼以被告举证为主，原告为辅。
3.赔偿诉讼可以适用解调，行政诉讼不适用调解。
4.两者审理的范围不同，赔偿诉讼审理赔与不赔，赔多赔少;行政诉讼审理行为合法性。
单独提请行政赔偿诉讼的前提要求有：
原告是符合规定的公民、法人或者其他组织；有明确的被告；有具体的诉讼请求和事实根据；属于人民法院受案范围和受诉人民法院管辖。
《中华人民共和国行政诉讼法》第四十九条
提起诉讼应当符合下列条件：
（一）原告是符合本法第二十五条规定的公民、法人或者其他组织；
（二）有明确的被告；
（三）有具体的诉讼请求和事实根据；
（四）属于人民法院受案范围和受诉人民法院管辖。
