合同中约定的保证金一般是能够退还的。保证金是具有担保性质的金额，其本质是用于核算存入银行等金融机构各种保证金性质的存款，法律也规定了当事人可以约定一方向对方给付定金作为债权的担保，债务人履行债务后，定金应当抵作价款或者收回。而如果不退还保证金的话，那么给付定金的一方不履行的，无权要求返还定金；收受定金的一方不履行约定的债务的，应当双倍返还定金。约定的债务的，无权要求返还定金；收受定金的一方不履行约定的债务的，应当双倍返还定金。
找法网提醒您，履约保证金与违约金的区别如下：
1.目的不同。履约保证金是以确保债权的实现为根本目的，属于担保的一种形式。而违约金目的在于制裁违约行为，属于民事责任的承担方式。
2.功能不同。违约金可以适用于不履行合同、履行合同不符合约定及履行指向的标的物质量不符合约定。履约保证金的重心在于担保合同的履行，重点在于履行这一行为。
3.交付时间不同。两者虽然都可以事先约定，但履约保证金一般在合同成立时即由合同当事人一方给付另一方当事人，用来约束合同给付一方的履约行为，而违约金一般属于事后救济的手段，约束合同双方或多方的履行。
4.发生的根据不同。履行违约金由当事人双方在合同中预先约定，因法律法规无明文规定，当事人无事先约定在司法实践中不会适用。违约金一般由当事人自己约定，无约定的可以参照法律规定适用。
保证金纠纷的起诉期限是三年，自纠纷产生之日起计算。法律规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。
《中华人民共和国民法典》第一百八十八条【普通诉讼时效、最长权利保护期间】向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。
诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。
