交通意外伤残认定的程序是：
1.当事人需要在治疗终结后十五日内向公安机关申请作伤残鉴定。
2.公安机关应当在二十日内完成鉴定，需要延期的经设区的市公安机关交通管理部门批准可以延长十日。
3.鉴定结果确定后，应当出具书面结论，由鉴定人签名并加盖机构印章。
4.当事人对公安机关交通管理部门的鉴定结论有异议的，可以在接到鉴定结论后三日内提出重新鉴定的申请。
5.经县级公安机关交通管理部门负责人批准后，应当另行指派或者委托专业技术人员、有资格的鉴定机构进行重新鉴定。
交通事故伤残鉴定部门包括：
1.司法鉴定中心;
2.司法鉴定事务所;
3.刑事科学技术研究所。
限制侦查机构即公安机构、国家安全机构和检察机构等鉴定的范围，即仅限于侦查工作需要，不得对外开展鉴定活动;不允许人民法院和司法行政管理部门设立鉴定机构，以体现司法公正和行政公正。
交通事故伤残鉴定机构是司法鉴定机构。委托人委托鉴定的，应当向司法鉴定机构提供真实、完整、充分的鉴定材料，并对鉴定材料的真实性、合法性负责。司法鉴定机构应当核对并记录鉴定材料的名称、种类、数量、性状、保存状况、收到时间等。
最长不超过六十日。
找法网提醒您，根据《道路交通事故处理程序规定》第四十九条需要进行检验、鉴定的，公安机关交通管理部门应当按照有关规定，自事故现场调查结束之日起三日内委托具备资质的鉴定机构进行检验、鉴定。
尸体检验应当在死亡之日起三日内委托。对交通肇事逃逸车辆的检验、鉴定自查获肇事嫌疑车辆之日起三日内委托。对现场调查结束之日起三日后需要检验、鉴定的，应当报经上一级公安机关交通管理部门批准。对精神疾病的鉴定，由具有精神病鉴定资质的鉴定机构进行。
