施工合同纠纷的调解方式是：协议优先;协商不成的申请基层组织进行调解;调解不成的可以向法院起诉;当事人有签订仲裁协议或仲裁条款的，可以申请仲裁机构进行仲裁。行为人可以不通过调解，直接诉讼或仲裁。
《民事诉讼法》第一百二十五条
当事人起诉到人民法院的民事纠纷，适宜调解的，先行调解，但当事人拒绝调解的除外。
《中华人民共和国仲裁法》第二条
平等主体的公民、法人和其他组织之间发生的合同纠纷和其他财产权益纠纷，可以仲裁。
找法网提醒您，施工合同适用担保，例如签订施工合同时，当事人可以约定支付定金作为担保，保证施工合同顺利履行。
《中华人民共和国民法典》
第三百八十七条 【担保物权的适用范围和反担保】债权人在借贷、买卖等民事活动中，为保障实现其债权，需要担保的，可以依照本法和其他法律的规定设立担保物权。
第三人为债务人向债权人提供担保的，可以要求债务人提供反担保。反担保适用本法和其他法律的规定。
第五百八十六条 【定金担保】当事人可以约定一方向对方给付定金作为债权的担保。定金合同自实际交付定金时成立。
定金的数额由当事人约定;但是，不得超过主合同标的额的百分之二十，超过部分不产生定金的效力。实际交付的定金数额多于或者少于约定数额的，视为变更约定的定金数额。
1.建设工程的范围；
2.建设工期。中间交工项目的开工和竣工时间；
3.工程质量标准；
4.工程造价；
5.技术资料交付时间；
6.材料和设备的供应责任；
7.结算方式和支付方式；
8.竣工验收方法、程序和标准；
9.质量保证范围和期限；
10.相互合作条款，违约责任条款需要注意的是，合法分包不能违反《中华人民共和国建筑法》规定，违反上述条件之一的，均为违法分包，违法分包合同无效。
