国有土地上企业拆迁按照如下方式补偿：
作出房屋征收决定的市、县级人民政府对被征收人给予的补偿包括：
1.被征收房屋价值的补偿;
2.因征收房屋造成的搬迁、临时安置的补偿;
3.因征收房屋造成的停产停业损失的补偿。市、县级人民政府应当制定补助和奖励办法，对被征收人给予补助和奖励。
找法网提醒您，国有土地上企业拆迁的流程如下：
1.进行项目征收立项；
2.房屋征收部门拟定征收补偿方案并报县区政府；
3.对拟征收房屋进行调查登记并公布调查情况；
4.有关部门对未经登记的建筑进行调查、认定和处理。
《国有土地上房屋征收与补偿条例》第十条
房屋征收部门拟定征收补偿方案，报市、县级人民政府。
市、县级人民政府应当组织有关部门对征收补偿方案进行论证并予以公布，征求公众意见。征求意见期限不得少于30日。
国有土地上企业拆迁的评估方式是：
根据国有土地上的房屋的市场价值、所产生的收益、被拆迁所带来的预知的风险等各方面进行评估，保证合法合规合理。
《国有土地上征收与补偿条例》第十九条
对被征收房屋价值的补偿，不得低于房屋征收决定公告之日被征收房屋类似房地产的市场价格。被征收房屋的价值，由具有相应资质的房地产价格评估机构按照房屋征收评估办法评估确定。
对评估确定的被征收房屋价值有异议的，可以向房地产价格评估机构申请复核评估。对复核结果有异议的，可以向房地产价格评估专家委员会申请鉴定。
房屋征收评估办法由国务院住房城乡建设主管部门制定，制定过程中，应当向社会公开征求意见。
