事业单位开除职工的程序为：
1.弄清所犯错误事实。
2.由单位有关行政领导或人事(组织)部门提出书面意见，说明辞退理由和事情依据。
3.经单位领导集体决定。
4.按人事管理权限办埋辞退手续。辞退要形成书面决定，并通知当事人，报同级政府人事部门备案。
5.发给当事人《辞退证明书》。办埋相关手续，如发给辞退费，做好工作和公共财物交接，人事档案转移，社会保险和住房公积金转移等。
6.当事人对辞退决定不服的，可到上级主管部门协调解决。
找法网提醒您，开除和辞退的区别如下：
1.类别、审批时效不同。开除是属于行政处分，而且是最严厉的一种处分；辞退属于行政处理，不属行政处分之列；
2.适用对象及其条件不同。开除处分适用于严重违法乱纪的职工；辞退仅适用于无正当理由经常旷工，经教育不改，连续旷工时间超过15天的职工；
3.性质不一样。辞退是用人单位解雇职工的一种行为，是用人单位由于某种原因与职工解除劳动关系的一种强制措施。开除是一种行政处分形式，开除是用人单位对具有严重违反劳动纪律和企业规章制度，造成重大经济损失和其他违法乱纪行为而又屡教不改的职工，依法强制解除劳动关系的一种最高行政处分。
劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。这里规定的仲裁时效，因当事人一方向对方当事人主张权利，或者向有关部门请求权利救济，或者对方当事人同意履行义务而中断。从中断时起，仲裁时效期间重新计算。
因不可抗力或者有其他正当理由，当事人不能在规定的仲裁时效期间申请仲裁的，仲裁时效中止。从中止时效的原因消除之日起，仲裁时效期间继续计算。劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬发生争议的，劳动者申请仲裁不受法律上规定的仲裁时效期间的限制，但是，劳动关系终止的，应当自劳动关系终止之日起一年内提出。
