对军人叛逃罪的处罚标准是犯本罪的，处五年以下有期徒刑或者拘役，情节严重的，处五年以上有期徒刑。驾驶航空器、舰船叛逃的，或者有其他特别严重情节的，处十年以上有期徒刑、无期徒刑或者死刑。
情节严重通常是指，国（边）境值勤人员利用职务之便外逃的；组织他人外逃的；携带武器外逃的；行凶殴打或以暴力威胁国（边）境执勤人员外逃的等。战争正在进行期间越境外逃；乘执行战斗任务之机外逃等。其他特别严重情节，是指胁迫他人叛逃的；策动多人或者策动军队中、高级指挥人员和其他负有重要职责（如机要人员）的人员叛逃的；携带重要或者大量军事秘密叛逃的；叛逃后为敌人效劳，进行严重危害国防安全活动的，等等。
符合以下标准逃离部队罪才立案：
1.持续3个月以上或3次以上逃离部队，或者逃离部队累计6个月以上的；
2.要职人员逃离部队的；
3.胁迫他人或策动3人以上逃离部队的；
4.执行重大任务的期间逃离部队的；
5.属于持械逃离部队等严重情节的。
找法网提醒，关于雇用逃离部队军人罪追诉期的规定是法定最高刑为无期徒刑、死刑的，追诉时效的期限为20年。如果20年以后认为必须追诉的，报请最高人民检察院核准后，仍然可以追诉。
