第二套房屋契税的计算公式即应纳税额计税依据×税率，对个人购买家庭第二套改善性住房，面积为90平方米及以下的，减按1%的税率征收契税；面积为90平方米以上的，减按2%的税率征收契税。纳税人申请享受税收优惠的，根据纳税人的申请或授权，由购房所在地的房地产主管部门出具纳税人家庭住房情况书面查询结果，并将查询结果和相关住房信息及时传递给税务机关。
首套房和二套房的认定要看是否满足如下条件，同时满足如下条件的属于首套房：
1.买房人年满18周岁；
2.买的房子是90平方米及以下的普通住房；
3.购房人现在名下没有单独或与他人共同购买的住房。
找法网提醒，与父母一起购买的、按照房改政策购买的、通过继承遗产或拆迁安置获得的住房除外。
二套房的契税缴纳流程大致如下：
1.办理房产信息查档证明
2.准备申报税务信息
需要准备采购合同、身份证原件及复印件的复印件，检查证明。
3.提交税务信息
材料准备好后，税务机关可以向地方税务局税务部门报税报税，并填写信用担保。
4.确认税务信息
税务部门在接受税务部门后，将输入相关信息，并列印一份房地产交易税报税表的复印件，其中将有纳税的基本信息，经过确认后仔细审核并确认签字。
5.支付的契税
在房地产交易税申报和审计表后到收款柜台缴纳契税。
