根据《中华人民共和国印花税暂行条例》规定：同一凭证，由两方或者两方以上当事人签订并各执一份的，应当由各方就所执的一份各自全部贴花。根据《中华人民共和国印花税暂行条例施行细则》规定：产权转移书据由立据人贴花，如未贴或者少贴印花，书据的拥有人应负责补贴印花。所立书据以合同方式签订的，应由拥有书据的各方分别按全部贴花。当事人如果各执一份，则均应全部征税。签订股权转让协议的双方当事人，都是印花税的纳税人，包括股权转让人和受让人。首先，转让方是个人。需要缴纳个人所得税，按照20%缴纳。如果是平价转让的，则不需要缴纳个人所得税。印花税，按照万分之五。双方都需要进行缴纳。其次，转让方是企业。需要缴纳企业所得税，契税，印花税等等企业所得税的税率为25%。符合条件的小型微利企业，减按20%的税率征收企业所得税。国家需要重点扶持的高新技术企业，减按15%的税率征收企业所得税。印花税则按照万分之五缴纳。
印花税是对经济活动和经济交往中订立、领受具有法律效力的凭证的行为所征收的一种税。因采用在应税凭证上粘贴印花税票作为完税的标志而得名。印花税的纳税人包括在中国境内设立、领受规定的经济凭证的企业、行政单位、事业单位、军事单位、社会团体、其他单位、个体工商户和其他个人。
国务院发出通知，决定自2016年1月1日起调整证券交易印花税中央与地方分享比例。国务院通知指出，为妥善处理中央与地方的财政分配关系，国务院决定，从2016年1月1日起，将证券交易印花税由现行按中央97%、地方3%比例分享全部调整为中央收入。国务院通知要求，有关地区和部门要从全局出发，继续做好证券交易印花税的征收管理工作，进一步促进我国证券市场长期稳定健康发展。
根据《中华人民共和国印花税暂行条例》第八条规定：同一凭证，由两方或者两方以上当事人签订并各执一份的，应当由各方就所执的一份各自全额贴花。因此，股权转让的双方应按产权转移书据缴纳印花税，税率为万分之五。
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