财政部、国家税务总局《关于印发〈关于个人独资企业和合伙企业投资者征收个人所得税的规定〉的通知》（财税［2000］91号）规定，合伙企业以每一个合伙人为纳税义务人。合伙企业的合伙者按照合伙企业的全部生产经营所得和合伙协议约定的分配比例确定应纳税所得额，合伙协议没有约定分配比例的，以全部生产经营所得和合伙人数量平均计算每个投资者的应纳税所得额；其中，生产经营所得，包括企业分配给投资者个人的所得和企业当年留存的所得（利润）。该文件同时规定，投资者应纳的个人所得税税款，按年计算，分月或者分季度预缴，由投资者在每月或者每季度终了后7日内预缴，年度终了后3个月内汇算清缴，多退少补。
财政部、国家税务总局《关于合伙企业合伙人所得税问题的通知》（财税［2008］159号）规定，合伙企业以每一个合伙人为纳税义务人。合伙企业合伙人是自然人的，缴纳个人所得税；合伙人是法人和其他组织的，缴纳企业所得税。合伙企业生产经营所得和其他所得采取“先分后税”的原则。
中国自然人投资于合伙企业，作为普通合伙人，按5%至35%的税率征税，作为有限合伙人，按20%的税率征税；中国法人企业投资于合伙企业，按25%的企业所得税率征税；而非居民企业投资于合伙企业，若作为非执行事务的合伙人（包括有限合伙人），仅需按10%的预提所得税率征收企业所得税，若作为执行事务的合伙人，则需按25%的税率征收企业所得税；外籍个人投资于合伙企业，若作为有限合伙人，则其投资所得。行业人士认为仍应适用免税规定；若作为执行事务的合伙人，则按5%至35%的税率缴纳个人所得税。
人独资企业所得税没有起征点的规定，但有税前扣除标准的规定：对个体工商户业主、个人独资企业和合伙企业投资者的生产经营所得依法计征个人所得税时，个体工商户业主、个人独资企业和合伙企业投资者本人的费用扣除标准统一确定为24000元年（2000元月）
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