公益信托与财团法人基金会都是以行善、公益为目的，但是公益信托具有成立门坎低、营运灵活等特点，可算是平民化的基金会，民众若想做善事，透过公益信托可以更简单。
当捐款人把钱捐到公益信托内，该笔财产就跟捐款人的财产以及受托银行的资产隔离，受到信托法的保护，具备财产独立性，这点也是基金会架构所无法达到的。
基金会是国内最为熟悉的做好事管道，过去让人诟病的是部分基金会沦为有钱人以为善之名，行逃漏税之实;另外，在低利率的环境下，基金会也面临了许多困境，因为基金会依法仅能运用孳息，目前利率仍不高，光靠孳息行善的范围有限。
公益信托则是国内新兴的行善架构，公益信托是指，以慈善、文化、学术、技艺、宗教、祭祀或其它公共利益为目的，由个人或团体捐赠设立之信托关系。
公益信托最大的特点是可以将捐款用到一毛不剩，不像基金会要受限于不可动用本金，而且成立规模有下限，依不同性质，最少要200万元至3,000万元。
透过信托架构，则是不管多少钱都可以成立公益信托，像是国内第一个公益信托只有10万元，除了中央机关统管性质的公益信托，因为具有全国性，因此成立金额最少要3,000万元之外，其余都没有限制。
而且公益信托不需配置相当营运人力、办公处或设备，建华银行就指出，可以进一步节约经费。
公益信托与基金会的公益功能几乎都相同，建华银行表示，公益信托甚至更便利及透明，可惜社会大众对于公益信托不熟悉，而不少银行信托部也因为公益信托不是「好赚」的业务，而不主动推广，这也是国内公益信托案不多的主因。
