有财税专家表示，电子商务征管面临很多难题，比如纳税环境难以判定、跨境电子商务征收管辖权难以判定等。电子商务交易过程无纸化、交易信息的电子化和交易主体的虚拟性，使得电商征税存在较大难度，因此很长时间内没有对与实体店税负能力相同的网店征税。同时，电商行业假货、仿货横行以及服务投诉等问题广受消费者诟病，尤其是C2C领域被称为监管盲区。
专家建议，若对电商征税，现行的税收法规政策需要进行适当的修订、完善，针对电子商务领域补充设置有关条款，尤其是针对纳税主体、征管对象、税收管辖等问题需要深入研究。同时，还应建立高素质的税收征管队伍，加强对电商的税收管理。
据了解，目前我国已有多家电商企业逐步在华北、华东、西南、华南等区域推行电子发票，并且有望于2015年在全国范围内推广，建立与电子工商登记配套的电子商务税收征管体系。
对于C2C平台的税收征管，有电商业内人士则建议可建立以网络交易平台为中心的控制“信息流”的税收征管模式，建立以银行和第三方支付平台为中心的控制“资金流”的税收征管模式。
