（一）因确认劳动关系发生的争议；
（二）因订立、履行、变更、解除和终止劳动合同发生的争议；
（三）因除名、辞退和辞职、离职发生的争议；
（四）因工作时间、休息休假、社会保险、福利、培训以及劳动保护发生的争议；
（五）因劳动报酬、工伤医疗费、经济补偿或者赔偿金等发生的争议；
（六）法律、法规规定的其他劳动争议。
申请劳动仲裁，劳动机关会保存相关的档案。所谓的案底，是司法机关处罚的档案，不包括劳动机关的仲裁档案。不会留下案底。
案底一般指某人过去犯法或犯罪行为的记录。又称犯罪人员犯罪记录制度，在我国法律中一般指有过刑事犯罪前科的档案记录，而该犯罪档案一般存放至公安部门保存。
申请劳动仲裁是发生纠纷之后才会申请的，而案底是在刑事案件的时候，犯罪才会有的，所以劳动仲裁，申请之后不会产生案底，因为没有构成犯罪。
因此，律师建议当用人单位侵犯劳动者合法权益时，劳动者应当积极应对，通过法律途径保护自身的合法权益，申请劳动仲裁不会对劳动者产生不利影响，反而可以维护自身合法权益。
但是，劳动仲裁的申请事项，大部分与经济相关，并且除了正常应当支付给劳动者的费用之外，可能还会产生经济补偿金、赔偿金或者双倍工资之类的，具有惩罚性的费用支出；如果用人单位败诉，最直接的影响就是，需要付出更多的经济成本。
劳动纠纷发生后，对企业的形象也是一个很负面的影响，如果网络发达，发生劳动纠纷后，劳动者可能在网上各种渠道发布企业的负面消息，这对企业以后的用人、企业信用，都会造成不可估量的影响；建议企业规范管理，发生劳动纠纷后，能协商处理的，尽量协商处理。
相关法律依据：
《中华人民共和国刑事诉讼法》第二百八十六条
犯罪的时候不满十八周岁，被判处五年有期徒刑以下刑罚的，应当对相关犯罪记录予以封存。 犯罪记录被封存的，不得向任何单位和个人提供，但司法机关为办案需要或者有关单位根据国家规定进行查询的除外。依法进行查询的单位，应当对被封存的犯罪记录的情况予以保密。
１、争议发生后一年内申请仲裁，递交仲裁申诉书；
２、仲裁委员会收到申诉书之日起五日内作出是否受理的决定；
３、仲裁庭开庭五日前书面通知双方当事人；
４、开庭，明确请求，答辩，调查事实，举证质证，辩论，陈述；
５、调解；
６、调解不成，裁决。
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