一、撤销原因不同。虽然二者的撤销原因均由法律规定，不能约定，但引起撤销的原因内容有着天壤之别，合同撤销权由一方或双方当事人意思表示有瑕疵引起，保全撤销权引起是由债务人实施了危害债权的积极行为引起。
二、是否突破合同的相对性不同。合同撤销权没有突破合同的相对性，而保全撤销权突破了。
1、撤销权人不同。合同撤销权由合同的当事人一方（欺、乘、胁）或双方（重大误解、显失公平）行使。
2、被撤销的行为不同。合同撤销权撤销的是自己的行为，在合同当事人之间有效；保全撤销权撤销的是他人的行为，对他人发生效力。
3、撤销的目的不同。合同撤销权制度设计的目的是维护意思表示有瑕疵的当事人的利益，保全撤销权制度的目的是维护被撤销合同之外的债权人利益。
三、两种撤销权的存续期间均为法定期间，原则上都是1年（从知道或应知起算），但保全撤销权有最长除斥期间5年的规定，合同撤销权没有此规定。
四、在性质上，一般认为合同撤销权为形成权，保全撤销权为形成诉权。因为，合同撤销权即可以通过法院行使，又可以通过仲裁机构行使，而保全撤销权只能向法院行使；更进一步讲，合同撤销权只要在诉讼中提出即可，故存在起诉、反诉、抗辩、反驳等多种表现形式，并不局限于诉讼请求，而保全撤销权由于撤销权人不是被撤销合同的当事人，故从慎重角度考虑必须提出诉讼请求
