一般来说，按照2007年4月1日起施行的《诉讼费用交纳办法》规定，房屋确权诉讼费的收费适用有两种做法，一是按件收费，二是按标的额收费。但是具体采取哪种标准，要看当地的法院实际做法和具体情况。此外，还要看房屋确权是财产案件还是非财产案件性质。
一、房屋确权不涉及财产案件：按件收费，每件50~100元
这类的房屋确权案件，没有涉及到财产给付，当事人就只提出了确认房屋归其所有的诉讼请求，属于单纯的确认之诉，诉讼费应按件收取，而不是按诉讼标的额，每件收取50~100元。
根据 《诉讼费交纳办法》第十三条的规定，不涉及离婚、侵害姓名权、名称权、肖像权、名誉权、荣誉权以及其他人格权的非财产案件，每件案件交纳50元至100元的案件受理费。
二、房屋确权涉及财产案件：按标的额收费
如果房屋确权涉及财产给付，如房屋的权属确认后、分割房产时，这时就属于涉及财产案件，应按标的额收取诉讼费用。这类的侵权案件虽然也有属于确认之诉的内容，但是因为涉及侵权赔偿的给付问题，《诉讼费交纳办法》将其特别规定为涉财案件，按标的额收取诉讼费。
计费标准如下，依据是《诉讼费用交纳办法》第十三条：案件受理费分别按照下列标准交纳：
（一）财产案件根据诉讼请求的金额或者价额，按照下列比例分段累计交纳：
1、不超过1万元的，每件交纳50元；
2、超过1万元至10万元的部分，按照2.5%交纳；
3、超过10万元至20万元的部分，按照2%交纳；
4、超过20万元至50万元的部分，按照1.5%交纳；
5、超过50万元至100万元的部分，按照1交%纳；
6、超过100万元至200万元的部分，按照0.9%交纳；
7、超过200万元至500万元的部分，按照0.8%交纳；
8、超过500万元至1000万元的部分，按照0.7%交纳；
9、超过1000万元至2000万元的部分，按照0.6%交纳；
10、超过2000万元的部分，按照0.5%交纳。
以上就是关于房屋确权案件的不同计费标准。综合看来，实践中，法院在处理房屋确权案件时还是以按标的额收费居多。由于各地法院对这类案件的性质划分和计费标准适用没有统一的规定，做法也不尽相同，具体还是以当地的实际操作为准。
