一、对强奸案件中被害人意志认定
强奸罪的客体是妇女性自主权利不受侵犯，其客观方面表现为违背妇女意志，使用暴力、胁迫或者其他手段，强行与妇女发生性关系的行为。在审理被告人的行为是否构成强奸罪，最关键的一点是，需要判断性行为发生时是否违背了被害人的意志。但被害人的意志是主观方面的表现，很难有直接、客观的证据来证明。在司法实践中，由于男女之间发生性行为时往往没有第三者在场目击，因此，当事人双方的口供起着至关重要的作用。但口供比起物证来说，虽然比较直观，但其较为不稳定。
二、物证的认定
现在社会是一个传媒时代，讲述犯罪的电影、电视、网络、书本等较多，有不少的被告人通过这些讲述犯罪的媒介学会了如何处理物证，例如将犯罪现场破坏、将沾有精斑的衣物等彻底毁灭等等。
三、强奸案件中被害人陈述的认定
一般来说，除被告人的供述之外，强奸案件的证据通常只有鉴定结论以及被害人陈述两类，而鉴定结论通常只能作为辅助证据存在。
