分居两地的居民自愿离婚的，男女双方应当共同到一方当事人常住户口所在地的婚姻登记机关办理离婚登记。《婚姻登记条例》第10条规定：“内地居民自愿离婚的，男女双方应当共同到一方当事人常住户口所在地的婚姻登记机关办理离婚登记。”
分居也可以诉讼离婚，居住在外地的一方提起诉讼，需要在对方户口所在地基层法院立案。居住在户口所在地的一方提起诉讼，在本地法院提起诉讼，也可以在对方经常居住地（连续居住1年以上）基层法院起诉。
《关于人民法院审理离婚案件处理问题的若干具体意见》第四条、第八条的规定，夫妻分居两地分别管理、使用的婚后所得财产，应认定为。对夫妻共同财产，原则上均等分割。根据生产生活的实际需要和财产的来源等情况，具体处理时也可以有所差别。对于分居两地的夫妻，在分割财产时，各自分别管理、使用的财产归各自所有。双方所分财产相差悬殊的，差额部分，由多得财产的一方以与差额相当的财产抵偿另一方。
婚姻关系解除的方式有两种，一是协议离婚经民政部门登记，二是到法院诉讼离婚。所以无论分居多长时间婚姻关系都不会自动解除，离婚必须通过相应的法律途径。
