根据我国相关法律的规定，农民工工伤赔偿同样适用工伤赔偿的程序和标准，具体操作步骤如下：
第一步，工伤认定程序，从工伤发生之日起，一般骨折大约为3个月。
1、发生工伤后单位应当自事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起30日内，向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。;单位未按规定提出工伤认定的，职工必须在1年内提出工伤认定的申请(假设职工是在受伤5个月后提出工伤申请)。
2、劳动者提出工伤认定申请后，劳动部门可以根据情况依法决定是否受理。
如果劳动部门受理了申请并在60日内作出了工伤认定结论。
第二步，工伤受理的行政诉讼程序(可能耗时6个月，如果出现发回重新审理的情形，可能增加耗时6个月)。
1、劳动者对劳动部门不受理工伤认定不服的，可以在60日内提起行政复议或者在3个月内直接向人民法院提起行政诉讼，要求法院判决劳动部门受理其工伤认定的申请。
2、我们假设职工在1个月后选择直接向法院提起行政诉讼。行政诉讼一审的审判期限为3个月。
3、任何一方不服一审判决，可以在15日内提起上诉。行政诉讼二审的审判期限为2个月。
二审的判决结果，可能是支持职工的诉讼请求(即判决由劳动部门受理工伤认定);也可能判决驳回职工的诉讼请求，此时劳动者的工伤维权程序结束。另外，二审的结果，还有可能是发回一审法院重审。而对一审法院重审的判决不服，还可以提起上诉。这样就出现了程序上的循环，耗时将有可能增加6个月。我们假设二审的判决结果是责令劳动部门受理工伤认定申请，那么案件进入到由劳动行政部门工伤认定的程序。
第三步，工伤认定程序(可能耗时1个月)。
劳动部门受理工伤认定后，如果单位提出异议，认为与劳动者不存在
劳动关系，而劳动者又无法提供有效的证据证明双方存在劳动关系，实践中劳动部门往往要求劳动者提起
劳动仲裁，由仲裁机构确认双方存在劳动关系后再恢复工伤认定程序。确认劳动关系的纠纷属于
劳动争议，应该先进行劳动仲裁。于是，案件将进入确认劳动关系的仲裁程序。
第四步，确认劳动关系的仲裁程序(可能耗时3个月)。
劳动者申请仲裁后，仲裁机构应当在60日内作出仲裁裁决书，由劳动争议仲裁委员会对是否构成劳动关系作出裁决。但是不服该裁决的，任何一方都可以向法院提起诉讼。于是，案件又进入到确认劳动关系的诉讼程序。
第五
