法院做法一：
通过举证责任分配及合理审查推断加班及休假事实是否存在
依据《最高人民法院关于审理劳动争议案件适用法律若干问题的解释(三)》第九条规定“劳动者主张加班费的，应当就加班事实的存在承担举证责任。但劳动者有证据证明用人单位掌握加班事实存在的证据，用人单位不提供的，由用人单位承担不利后果。”劳动者主张加班费的，应当就加班事实的存在承担举证责任。因劳动者举证能力较弱，很难搜集到充分的加班证据，大部分劳动者都无法提供直接证据证明存在加班事实。在这种情况下，劳动者可以提供线索表明有加班的事实，如工资条等。如果劳动者有证据证明用人单位掌握加班事实存在的证据，用人单位不提供的，由用人单位承担不利后果。在劳动者有初步证据的情况下，法院会认真审查相关证据，尽可能查明劳动者加班的事实。在用人单位拒不配合的情况下，法院也会依法推定劳动者存在加班事实，保障劳动者的合法权益。
法院做法二
通过调解化解纠纷
社会现实中用工状况非常复杂，我国现阶段劳动者加班加点严重有方方面面的原因。在一些案件审理中，往往由于用人单位管理不规范，缺乏相应的考勤、休息休假制度以及加班费工资基数不明确，而劳动者又难以提供切实有效的证据来证明确切的加班事实，当事人双方往往就工资数额及加班费工资基数等各执一词，法官很难根据现有证据计算出劳动者加班费的准确数额。在这种情况下，法官们更倾向于通过调解来解决争议，通过耐心细致的释法明理，使当事人双方互谅互让从而化解纠纷。
法院做法三
加强推行诚信诉讼告知制度，规范当事人诉讼行为
劳动争议案件具备一定的特殊性，当事人不诚信诉讼现象突出，一些用人单位为了逃避责任，伪造劳动合同、考勤表、工资表、工资发放记录、规章制度、工作量表或其他证明文件等书证，一些劳动者为了索要加班费，自行编造存在加班的证据。为此，我院从2014年开始实施诚信诉讼告知制度，主要做法是制作诚信诉讼告知书，明确告知诉讼参与人如果实施虚假诉讼、恶意诉讼或伪造、毁灭重要证据等严重妨害民事诉讼的不诚信行为，法院将视情节轻重，分别处以罚款、拘留甚至追究刑事责任的处罚，同时法院还将向新闻媒体通报。
法官在正式开庭前，向双方诉讼参与人讲解告知书文本内容，释明其诚信诉讼义务，并告知其违反后果，同时要求诉讼参与人在告知书的保证栏内签字，确认已阅读告知内容，并承诺在诉讼中遵守诚实信用原则，如有违反愿意接受相应处罚。在充分告知、释明及提醒的基础上，对仍然违反诚信诉讼义务的诉讼参与人，坚决追究其法律责任，以达到惩罚与震慑的目的。2014年，我院在审理一起劳动者索要加班费的案件中，对被明确认定为通过伪造公章伪造虚假证明的用人单位处以十万元罚款，该用人单位服从罚款决定并一次性缴清。
【法院建议】
用人单位要严格遵守法律法规，依法规范用工。用人单位要切实改变粗放式经营、粗放式管理的做法，严格依法保证劳动者的休息休假权。根据企业经营需要，可以实行综合工时制或不定时工时制的，要及时向人力社保部门报批，否则一旦与劳动者就加班事项发生争议，用人单位以实行综合工时制或不定时工时制抗辩的，法院将不予采信。用人单位在与劳动者签订劳动合同时，最好与劳动者就加班时间、加班费计算基数等进行详细约定，并且尽可能避免出现明显损害劳动者权益的约定，做好纠纷预防工作。在日常管理中，用人单位要细化工资制度，做好考勤记录和工资发放时的手续，避免出现争议后双方各执一词。在与劳动者发生纠纷后，用人单位确有安排劳动者加班事实的，要拿出诚意与劳动者协商解决，互谅互让，尽可能实现双赢。
对劳动者而言，要提高自身在劳动法、劳动合同法及有关休息、休假等相关法律法规的法律知识，知道如何利用法律来保护自身权益。在与用人单位签订劳动合同时，要争取将适用何种工时、工作时间、加班费计算基数等予以明确约定。用人单位安排加班又不支付加班费的，劳动者要注意搜集留存证据，以便一旦通过仲裁或诉讼程序解决问题，避免出现虽然有加班事实但因无证据证明从而导致败诉的情况。
