如果建设工程施工合同的承包人就是实际施工人，那么，不论是因工程质量引起的建设工程施工合同纠纷，还是因其他原因引起的建设工程施工合同纠纷，发包人都可以且只能起诉承包人。但是，司法实践中，建设工程施工合同中转包、违法分包的情况很常见，建设工程施工合同的承包人往往并不是实际施工人，针对这种情况，《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释》第25条规定：“因建设工程质量发生争议的，发包人可以以总承包人、分包人和实际施工人为共同被告提起诉讼。”
根据《民事诉讼法》规定，因合同纠纷提起的诉讼，由被告住所地或者合同履行地人民法院管辖。建设工程施工合同的合同履行地为施工行为地。因此，施工企业可选择向被告住所地或者施工行为地人民法院起诉。
因建设工程施工合同争议数额有的比较大，故还要注意级别管辖的问题。即建设工程施工合同争议数额达到或超过某一特定数额，该案就只能由被告住所地或者施工行为地的中级人民法院或高级人民法院管辖。
《建设工程质量管理办法》规定：因建设工程质量存在缺陷造成损害要求赔偿的诉讼时效期限为一年，自当事人知道或应当知道其权益受到损害时起计算。这表明，我国建设工程质量纠纷的诉讼时效为三年。如果需要起诉对方的话，那么一般建议在两年的时间之内比较好，对于建筑工程最重要的就是质量问题了，质量不达标那么有可能会引发严重的安全事故。
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