工程审计是依据国家《审计法》等相关规定，对工程概、预算在执行中是否超支，有无隐匿资金、截留基建收和投资包干结余，以及有无以投资包干结余的名义私分基建投资的违纪行为等。审计是以基建项目为标的，以会计师、审计师为主要从业人员。工程审计包括工程造价审计和竣工财务决算审计两大类型。
工程审计收费标准如下计算：
1、只委托做初步设计或施工图设计时，按照行业划分设计工作量各占的比例并乘以1.1的系数计算收费。如果增加编制施工图预算，按工程设计收费标准乘以1.1系数计算收费。
2、工程设计中采用标准设计（标准构配件图除外）、复用设计，按同类新设计项目的20%收费。
3、进行工程技术咨询服务，参加规划调查、询价、报价、对外谈判等技术服务工作，以及没有制订具体收费标准的工作，可采用按直接生产人员工日计算收费的办法，收费标准为每工日85元。工曰的计算可执行工日定额或由设计方和委托方根据任务情况在签订合同时协商确定。需要到外埠出差，工期在六十天以内的任务，其差旅费由委托单位负担，工程设计单位由于所承担任务的需要而出国时，除制装费由设计单位支付外，其他出国费用（包括外汇额度）均应由委托单位支付。
4、收费标准中考虑了各种影响设计工作量因素的调整系数，如果在同一项目中的两种以上因素同时存在，由该项目总的调整系数应为各单项调整系数小数点以后数字之和再加1,但总的调整系数最高值不得大于1.5.
5、按实物或工日定额计取设计费的，凡投资在3亿元以上的项目，其费额最高不得大于概算比例的1.5%.
6、有较好的经济效益，经设计审查确认，可由上级主管审查部门决定，适当增加设计费，一般控制在设计费的10%以内如果设计质量和技术水平达不到合同要求的，应按合同规定扣减设计费。
7、设计费按设计进度分期拨付。设计合同生效后，委托方应向设计单位预付设计费的20%。
有政府性投资的建设项目，一律要进行工程审计。即所有行政、事业单位的建设项目都要经过造价审计和财务决算审计。非政府性投资的建设项目，规模较大而且涉及的利害关系人较多的，必须进行工程造价审计，比如房开企业开发的房地产。企业建造自用的建设项目由企业决定是否审计。
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