1、犯罪客体不同。非法经营罪的具体规定在我国《刑法》的第五章第八节扰乱市场秩序罪中，说明非法经营罪所侵犯的客体是市场秩序。而赌博罪的相关规定在我国《刑法》第六章第一节扰乱公共秩序罪中，说明赌博罪所侵犯的客体是公共秩序。
2、犯罪客观方面不同。非法经营罪的行为主要表现在：
（1）未经许可经营法律、行政法规规定的专营、专卖物品或者其他限制买卖的物品；
（2）买卖进出口许可证、进出口原产地证明以及其他法律、法规规定的经营许可证或者批准证件；
（3）其他严重扰乱市场秩序的非法经营行为，非法经营证券、期货或者保险业务，非法从事资金支付结算业务；
（4）其他严重扰乱市场经济秩序的非法经营行为。
赌博罪的行为主要是：以营利为目的，聚众赌博。
3、犯罪主观方面不同。非法经营罪和赌博罪都是故意，但是非法经营罪是通过买卖谋取利润为目的，赌博则是为了营利，聚众赌博、以赌博为业的行为人，才能构成赌博罪。
根据《刑法》第二百二十五条，“违反国家规定，有下列非法经营行为之一，扰乱市场秩序，情节严重的，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处违法所得一倍以上五倍以下罚金；情节特别严重的，处五年以上有期徒刑，并处违法所得一倍以上五倍以下罚金或者没收财产：
（1）未经许可经营法律、行政法规规定的专营、专卖物品或者其他限制买卖的物品的；
（2）买卖进出口许可证、进出口原产地证明以及其他法律、行政法规规定的经营许可证或者批准文件的；
（3）未经国家有关主管部门批准非法经营证券、期货、保险业务的，或者非法从事资金支付结算业务的；
（4）其他严重扰乱市场秩序的非法经营行为。”对非法经营罪处以五年以下有期徒刑或者拘役和五年以上有期徒刑，并处罚金或者没收非法所得。
根据《刑法》第三百零三条，“以营利为目的，聚众赌博或者以赌博为业的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处罚金。开设赌场的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处罚金；情节严重的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金。”对赌博罪处以三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处罚金。
