实行招标、拍卖、公开协商等方式承包农村土地的，按照下列程序办理农村土地承包经营权证： 第一，土地承包合同生效后，承包方填写农村土地承包经营权登记申请书，报承包土地所在乡(镇)人民政府农村经营管理部门。 第二，乡(镇)人民政府农村经营管理部门对发包方和承包方的资格、发包程序、承包期限、承包地用途等予以初审，并在农村土地承包经营权证登记申请书上签署初审意见。 第三，承包方持乡(镇)人民政府初审通过的农村土地承包经营权登记申请书，向县级以上人民政府申请农村承包经营权证登记。 第四，县级以上地方人民政府农业行政主管部门对登记申请予以审核。申请材料符合规定的，编制农村土地承包经营权证登记簿，报请同级人民政府颁发农村土地承包经营权证;申请材料不符合规定的，书面通知申请人补正。 第五，乡(镇)人民政府农村经营管理部门领取农村土地承包经营权证后，应在30个工作日内将农村土地承包经营权证发给承包方。发包方不得为承包方保存农村土地承包经营权证。
《中华人民共和国土地管理法》第十一条 农民集体所有的土地，由县级人民政府登记造册，核发证书，确认所有权。 农民集体所有的土地依法用于非农业建设的，由县级人民政府登记造册，核发证书，确认建设用地使用权。 单位和个人依法使用的国有土地，由县级以上人民政府登记造册，核发证书，确认使用权；其中，中央国家机关使用的国有土地的具体登记发证机关，由国务院确定。 确认林地、草原的所有权或者使用权，确认水面、滩涂的养殖使用权，分别依照《中华人民共和国森林法》、《中华人民共和国草原法》和《中华人民共和国渔业法》的有关规定办理。
