合同纠纷过了三年诉讼时效，当事人仍有起诉权。
1.即使超过了诉讼时效期间，权利人仍然可以向人民法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。
2.一旦法定的诉讼时效期间届满，权利人再行使请求权，人民法院就不再予以保护。
换句话说，如果义务人提出诉讼时效抗辩，并且法院查明确实存在超过诉讼时效且无中止、中断、延长事由的情况，那么权利人的诉讼请求将被驳回。
3.如果另一方当事人未提出诉讼时效抗辩，则视为其自动放弃该权利，法院应当受理并支持其诉讼请求。
找法网提醒，在合同纠纷中，诉讼时效通常为3年。这一规定适用于大多数合同纠纷情况。具体的诉讼时效起算时间可能因合同的不同情况而有所差异。例如：
1.当合同未约定履行期限时，诉讼时效从权利人第一次向义务人主张权利时起算。
2.对于分期履行的合同，则应按每笔相对独立的债权履行期限届满时分别起算。
3.对于保证债务，如果债权人在保证期间内向保证人主张了权利，则保证责任的诉讼时效从此开始计算。
4.合同无效或合同解除的情况下，诉讼时效的起算也有相应的规定。
需要注意的是，诉讼时效的中断和重新开始计算也有具体的规定，如起诉、撤诉、公告催债等行为都可能对诉讼时效产生影响。
合同纠纷过时效后，处理方式主要取决于另一方当事人是否提出诉讼时效抗辩以及法院的具体裁定。
1.如果另一方当事人提出诉讼时效抗辩，并且法院查明确实存在超过诉讼时效且无中止、中断、延长事由的情况，那么权利人的诉讼请求将被驳回。
此时，权利人可能需要考虑其他途径来维护自己的合法权益，如通过调解、仲裁等方式解决纠纷。
2.如果另一方当事人未提出诉讼时效抗辩，则法院将受理并支持权利人的诉讼请求。即使在这种情况下，权利人也需要考虑到诉讼成本和诉讼风险等因素，谨慎决定是否继续诉讼。
3.为了避免类似情况的发生，建议当事人在签订合同时就明确约定合同履行期限和诉讼时效等相关条款，以减少纠纷的发生和诉讼成本。
