公司股东私下签订的协议书，在一般情况下是有效的。这主要基于《公司法》第71条的规定，股东之间可以相互转让全部或者部分股权。然而，这种私下协议可能会影响到协议的履行。
例如，如果股东与股东之外的人签订股权转让协议但没有通知其他股东，即便买方支付了股权转让款，也无法到工商部门办理股权变更登记，这样的股权转让协议将难以履行。
因此，虽然私下签订的股权转让协议在大多数情况下是有效的，但为了确保协议的顺利履行，公开透明地进行股权转让并遵循相关法律法规进行操作是更为稳妥的做法。
股权变更登记流程包括以下步骤：
1.领取《公司变更登记申请表》：首先需要从工商局办证大厅窗口领取该表格。
2.变更营业执照：填写公司变更表格，加盖公章，整理公司章程修正案、股东会决议、股权转让协议、公司营业执照正副本原件，然后到工商局办证大厅办理变更手续。
3.变更组织机构代码证：填写企业代码证变更表格，加盖公章，整理公司变更通知书、营业执照副本复印件、企业法人身份证复印件、老的代码证原件，然后到质量技术监督局办理变更手续。
4.变更税务登记证：拿着税务变更通知单到税务局办理变更手续。
5.变更银行信息：拿着银行变更通知单到基本户开户银行办理变更手续。
通过以上五个步骤，可以完成股权变更登记的全部流程。需要注意的是，在进行股权变更登记时，必须遵循相关法律法规和程序，确保变更过程的合法性和有效性。
在股权转让交易中，转让方为纳税义务人，而受让股权的一方是扣缴义务人，需要履行代扣代缴税款的义务。具体来说;
1.股权交易各方在签订股权转让协议并完成股权转让交易以后至企业变更股权登记之前，负有纳税义务或代扣代缴义务的转让方或受让方，应到主管税务机关办理纳税申报。
2.同时，还需要持税务机关开具的股权转让所得缴纳个人所得税完税凭证或免税、不征税证明，到工商行政管理部门办理股权变更登记手续。
3.如果股权交易各方已经签订了股权转让协议但尚未完成交易，企业在向工商行政管理部门申请股权变更登记时，应填写《个人股东变动情况报告表》并向主管税务机关申报。
这些纳税细节是股权转让过程中必须注意的事项。遵守相关法律法规和纳税规定，不仅可以保障交易的合法性和有效性，也可以避免因违反税法而产生的不必要的风险和损失。
因此，在进行股权转让时，转让方和受让方都应充分了解并遵守相关纳税规定，确保交易的顺利进行。
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