依据《工资支付暂行规定》等法律文件，代理记账公司若因员工丢失货物而欲扣发工资，须遵守法律界定的权限。
具体来说，工资扣减不得超过员工当月工资的20%，且扣减后的工资不得低于当地的最低工资标准。这里的要点包括：
1.扣减工资是对造成经济损失的员工的一种惩罚措施，但其实施必须在法律允许的范围内；
2.扣减的最大限额是严格规定的，即不得超过20%；
3.无论扣减多少，员工的实际到手工资应不低于当地最低工资标准，确保劳动者的基本生活需求得到保障。
根据《劳动合同法》的相关条款，企业不得单方面降低员工工资。工资调整必须基于与劳动者的协商并得到书面同意。
企业在劳动合同中预设调整工资的条款，或以调岗为由降低工资待遇，若未经劳动者同意，均属违法。这意味着：
1.劳动报酬是劳动合同的必备条款，其变更必须遵循法定程序；
2.任何关于降薪的决定都需劳动者的同意，保障劳动者对自身劳动价值的控制权；
3.若企业违反上述规定，劳动者有权申请劳动仲裁维护自身权益。
