快递公司丢失快递进行赔偿的方法是：
当事人让快递有保价的，按照快递保价额赔偿；快递部分损毁或者内件短少的，按照保价额与邮件全部价值的比例对快递的实际损失予以赔偿。没有保价的，按照收件人实际的损失赔偿，但最高赔偿额不超过所收取资费的三倍。
《邮政法》第四十七条
邮政企业对给据邮件的损失依照下列规定赔偿：
(一)保价的给据邮件丢失或者全部损毁的，按照保价额赔偿；部分损毁或者内件短少的，按照保价额与邮件全部价值的比例对邮件的实际损失予以赔偿。
(二)未保价的给据邮件丢失、损毁或者内件短少的，按照实际损失赔偿，但最高赔偿额不超过所收取资费的三倍；挂号信件丢失、损毁的，按照所收取资费的三倍予以赔偿。
邮政企业应当在营业场所的告示中和提供给用户的给据邮件单据上，以足以引起用户注意的方式载明前款规定。
邮政企业因故意或者重大过失造成给据邮件损失，或者未履行前款规定义务的，无权援用本条第一款的规定限制赔偿责任。
1.采取协商处理的方式，和解解决；
2.在协商不成的情况下，向有关组织请求调解或向相关部门投诉；
3.双方协议提请仲裁，或是向人民法院提起诉讼，寻求司法救济维护自己的权益。
记得附证据清单，与事实有关的证明材料，如快递单据、发票等。而且应该按照被投诉者数提出诉状副本，并依法在纠纷解决过程中提供新证据。
找法网提醒您，快递公司丢失快递赔偿纠纷的管辖法院一般是快递公司住所地的法院。
《民事诉讼法》第二十二条
对公民提起的民事诉讼，由被告住所地人民法院管辖；被告住所地与经常居住地不一致的，由经常居住地人民法院管辖。
对法人或者其他组织提起的民事诉讼，由被告住所地人民法院管辖。
同一诉讼的几个被告住所地、经常居住地在两个以上人民法院辖区的，各该人民法院都有管辖权。
