大病二次报销的程序为：首先准备好报销的资料，包括出院证、正式发票、费用清单、户口本、身份证、农村合作医疗证、入院记录、出院记录等材料；申请人将重疾大病二次报销所需资料备齐后交村或者社区合作医疗联络员审核，审核通过后再由联络员送到相应的结报中心进行报销。
法律依据：
《中华人民共和国社会保险法》第二十五条
国家建立和完善城镇居民基本医疗保险制度。城镇居民基本医疗保险实行个人缴费和政府补贴相结合。享受最低生活保障的人、丧失劳动能力的残疾人、低收入家庭六十周岁以上的老年人和未成年人等所需个人缴费部分，由政府给予补贴。
1.身份条件。
居民必须参加城乡居民医疗保险或者参加“新农合”，并且单独购买，此时的身份可以进行医疗保险的“二次报销”。
2.开销条件。
以北京为例，居民在上一年度使用基本医疗保险报销之后，城镇居民在基本医疗保险政策范围内个人自付超过上一年度北京市城镇居民年人均可支配收入的费用，农村居民在基本医疗保险政策范围内，个人自付超过上一年度北京市农村居民年人均纯收入的费用，此时的治疗开销条件是可以进行医疗保险的“二次报销”的。
3.材料条件。
居民在进行“二次报销”的时候，需要提前准备好所需的患者病历、身份证、出院证明、第一次的报销单等材料(因行政区域不同，“二次报销”所需的详细证件材料清单可能略有所不同，可咨询当地报销单位)。此时的材料准备是可以进行医疗保险的“二次报销”的。
找法网提醒，大病二次报销是有时间限制的，一般为六个月左右。所以，参保人应注意这一时间，以免错过报销时间导致不能报销的情况。其中，新农合大病二次报销需要参保人提供的资料有：参合正原件、居民身份证或户口本原件、新农合补偿结算单、费用清单、出院小结、医疗机构费用发票、患者提供银行汇款账号等资料。而参保了新型农村合作医疗保险的居民在正常医保的报销之后，剩下的医保范围内个人自付费用，如果超过了上一年度全市居民年人均可支配收入，其超出的部分就可以进行报销。如果超出部分为5万元以内，即可以由大病保险报销50%，如果是超过5万元的，可以由大病保险报销60%。
